Самыми распространенными в сфере охраны природы являются нарушения законодательства о лесопользовании, об охране животного мира, а также невнесение организациями оплаты за негативное воздействие на окружающую среду. Так при проверке 169 предприятий и организаций прокуратурой области, было установлено, что 7 предприятий, среди которых, например, ООО «Черняховская ТС» и МУЗ «Озерская – ЦРБ» не состоят на государственном учете в качестве плательщика за негативное воздействие на окружающую среду.
Кроме того, 39 объектов вообще не имеют разрешения на выброс вредных веществ в атмосферный воздух. В целом, в 2009 году заметно возросло количество выявленных прокуратурой нарушений и мер реагирования: к дисциплинарной ответственности привлечено 223 лица, к административной ответственности 214 лица, в суд направлено 70 заявления, а по результатам проведенных проверок возбуждено 5 уголовных дел.