Основными целями применения МИДК являются сокращение времени таможенного оформления и контроля товаров и транспортных средств с учётом выборочности на основе системы управления рисками.
Использование МИДК позволяет повысить эффективность применения форм таможенного контроля на погранпостах.
В результате работы МИДК в 2009 году было возбуждено 5 уголовных дел и составлено около 300 протоколов об административных правонарушениях.
Наиболее крупными задержаниями были более 100 тонн вывозимого на экспорт лома черных металлов стоимостью более 5 миллионов рублей, а также ввоз на территорию Российской Федерации незадекларированных товаров народного потребления из стран Юго-Восточной Азии на сумму более 2 миллионов рублей.
Рассматривается вопрос об оснащении Калининградской областной таможни третьим МИДК. Кроме того, проводятся мероприятия по организации круглосуточной работы МИДК и, соответственно, увеличению штата должностных лиц, обеспечивающих их эксплуатацию.
